医院创建于年，系国家卫计委预算管理单位、医院，是集医、教、研、防为一体医院，全国儿科学重点学科、国家“工程”和“”工程建设单位，最早被国家授予儿科学硕士、博士学位授权点、临床医学博士后流动站。
医院创建于年，系国家卫计委预算管理单位、医院，是集医、教、研、防为一体医院，全国儿科学重点学科、国家“工程”和“”工程建设单位，最早被国家授予儿科学硕士、博士学位授权点、临床医学博士后流动站。
医院宗旨：一切为了孩子。医院使命：建树医学典范，呵护儿童健康。医院定位：立足上海、服务全国、辐射亚洲。医院愿景：亚洲一流的儿童医学中心，儿科医学教育向全国辐射的中心，中外儿科学术交流的重要桥梁。医院院训：团结、奋进、严谨、创新。医院理念：尊重、平等、热情、关爱。
截止年底，在职职工人，高级职称专家人，博士生导师32名，硕士生导师31名。
医院开放床位张，年门急诊服务量逾万，出院病人突破4.2万人次，住院手术2.8万。
医院专业设置齐全，共设45个临床专业医技科室，拥有7个国家临床重点专科，包括：新生儿、重症医学科、小儿消化科、中医儿科、新生儿疾病重点实验室、小儿外科、临床护理。
新生儿、外科、心血管、传染病等专业曾先后被列为卫生部临床学科重点专业。新生儿科是上海市医学重点学科，儿科学是上海市重中之重重点学科，小儿外科是上海市小儿外科疑难重症临床医学中心，呼吸急救专业是上海市医学领先专业。
医院有2个省部级重点实验室，分别为卫生部新生儿疾病重点实验室和上海市出生缺陷防治重点实验室。
小儿内科1
新生儿科新生儿科创建于年，是国家临床重点专科，上海市医学重点学科，上海市危重新生儿会诊抢救中心，年成立卫生部新生儿疾病重点实验室。现有开放床位张，设重症监护病房（NICU）、早产儿病房和足月儿病房，病房面积平方米，是我国最大的新生儿医疗中心、新生儿人才培养中心、新生儿科研中心及学术交流中心之一。
02
呼吸科小儿呼吸病专业建立于年，有统一管理的呼吸病专业病区、呼吸专科门诊，并配有纤维支气管镜室、肺功能室、雾化治疗室及特异性免疫治疗室。
对患儿进行免疫学、变态反应、病原学及病理学等方面检查，除了解决儿科常见病，如支气管哮喘、慢性咳嗽、反复呼吸道感染等的诊断、规范化治疗和临床指导外，重点解决儿童疑难和重症肺部疾病的诊治。
03
神经科医院神经专业成立于年，是当时全国成立最早的儿科神经专业之一；年开设内科神经专业病区；医院、医院一起成立复旦大学癫痫中心，年成立独立建制的神经科，神经科科室组建目前包括神经科病房、神经专科门诊、神经电生理室（包括脑电图与肌电图室）、神经病理室。
04
血液科血液科包括专科病房，专科门诊及日间化疗诊区。血液科专科病房拥有33张床位，包括普通床位28张，国内设置先进的层流仓3个，层流过渡舱2个，主要收治大剂量化疗肿瘤患儿、移植患儿和难治性血液系统疾病患儿。
血液科专科门诊包括专科医生诊疗室2间及导管维护门诊1间，主要诊治各类儿童贫血、出凝血疾病、白细胞疾病、血液肿瘤及部分实体瘤的诊断及随访治疗，肿瘤患儿导管的日常维护等。
日间化疗诊区1间房间，含7张化疗床位，承担日间小剂量化疗等门诊支持治疗。医院血液实验室设备精良，拥有骨髓细胞形态、流式细胞术、染色体细胞遗传技术和FISH分子基因诊断技术等血液肿瘤疾病先进诊断技术和能力。
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消化科儿童消化系统疾病、营养支持及内镜诊疗，具体包括：胃炎、消化性溃疡的诊断和治疗；幽门螺杆菌的检测及其相关性消化系统疾病的治疗；儿童炎症性肠病（Crohn’s病和溃疡性结肠炎）的诊断和治疗；儿童急慢性腹泻；儿童过敏性胃肠炎；胃食管反流的诊断和治疗；消化道出血急诊胃镜检查和治疗；食管、胃内异物钳取；胃肠息肉摘除；食管胃底静脉曲张的内镜治疗；儿童双气囊小肠镜检查等
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内分泌遗传代谢科科室临床医疗工作包含专业病房、专科门诊和质谱室，分别开设有内分泌、遗传代谢、少女妇科三个系列的专科、专家、高级专家和特需服务门诊等门诊，以满足不同层次的服务需求。通过与转化医学中心、儿研所等院内科室间的协作，建立了若干具有国内领先水平的临床综合解决方案，初步实现了“临床诊断-质谱诊断-分子诊断-内科治疗-外科治疗”为模式的个体化整合医疗模式。
具有解决内分泌遗传代谢病的多学科综合实力，诊治病种几乎涵盖所有内分泌遗传代谢疾病，内分泌疾病方面如儿童糖尿病、新生儿糖尿病、儿童矮小症、性早熟、肥胖症、低血糖、甲状腺疾病、先天性肾上腺皮质增生症等疾病的治疗方面取得了丰富的经验。
遗传代谢病方面如普拉德.威利综合征、有机酸血症、脂肪酸代谢障碍等疾病的急诊处理和随访治疗方面，同样也取得了较丰富的经验，是国内少数几个具备多方位诊治技术和能力的单位之一。
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肾脏风湿科肾脏风湿科临床诊治范围广、疑难病人多、外院转诊病人多，以慢性肾脏病早期发现和干预、先天性肾脏和尿路畸形早期发现和内外科联合治疗、终末期肾病的综合治疗和管理为特色，诊治范围包括原发性肾小球肾炎、肾病综合征、乙型肝炎病毒相关性肾炎、泌尿道感染、先天性肾脏和尿路畸形、肾小管疾病和间质性肾炎、急性肾损伤、慢性肾脏病（包括终末期肾病即尿毒症）等肾脏疾病的诊治、随访和管理；幼年特发性关节炎、系统性红斑狼疮、干燥综合征、皮肌炎等风湿性疾病的诊治、随访和管理。
