先天性腹泻和肠病（CODEs）是一组异质性很大的遗传性疾病，在新生儿出生后的头几个月出现严重的慢性腹泻，通常需要营养支持和广泛的医疗保健。最近审阅了CODE的分类和新诊断方法，基于新一代测序，在CODE患者中发现存在罕见的单基因遗传疾病。通过精确医学进行早期识别和及时干预对于CODE患者及其家属至关重要。最近医院消化内科黄瑛教授与免疫科王晓川教授及新生儿科等教授合作对名CODE患者进行分子诊断与研究，相关研究发表于医学遗传学顶级期刊GeneticsinMedicine.
该项目搜集到从年1月到年9月的名婴儿早期的慢性腹泻患者，由于患有过敏性疾病，新生儿坏死性小肠结肠炎和短肠综合征的获得性腹泻被排除在外，具体表型分组见下图
基因检测方法包括全外显子测序与Panel测序。
结果
CODE患者的组织学和免疫组化评估（(a)Hematoxylinandeosin(HE)analysisofthedescendingduodenumshowsthelossofgobletcellsandPanethcellsandthepresenceofapoptoticcellsinpatient89.(b)HEanalysisofthesmallbowelshowshypoplasiaofvilliandcrypt,withmonocyticinfiltrationinalllayers.(c)HEanalysisofcolonicbiopsyrevealshistiocyticinfiltrationandirregularcellularityinpatient99.(d)ImmunochemicalstainingshowsCD1amarkerpositivityinthesamepatient.）
名患者中有88名获得诊断，阳性率达到64.2%。
致病基因的发病时间各不相同，具体如下图
大多数CODE本质上属于单基因遗传病，遗传变异可以分为直接影响肠上皮或免疫系统。据我们所知，这是最大的CODE患者队列，分子诊断对于CODE患者至关重要，因为结果可以为潜在的治疗靶点提供信息，造血干细胞移植可能对由IL10，IL10RA，IL10RB，CYBB，CYBA，NCF1，NCF2，NCF4，FOXP3和XIAP7基因的致病变异引起的单基因疾病有治疗作用，并且对EPCAM或TTC7A致病变异无效。与以往研究相比，本研究的阳性诊断率更高，内窥镜检查，H＆E分析和特异性免疫组织化学可能有重要作用。
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